九头蛇组织冒充神盾局攻击联合国，全世界都开始声讨神盾局这个“流氓组织”。与此同时，一个出人意料的敌人给神盾局小组带来了巨大的挑战，难道他们的末日真的到来了吗？看起来不止是神盾局小组，就连托巴将军本集也遇到了大麻烦。